Государственное Предприятие (ГП) "Кыргызаэронавигация" является государственным предприятием по управлению воздушным движением и технической эксплуатации наземных средств радиотехнического обеспечения полетов и электросвязи.

История первых самостоятельных шагов предприятия берёт начало с Постановления Правительства Кыргызской Республики за №610 от 18 октября 1997 года ""О разграничении функций государственного регулирования и хозяйственной деятельности в гражданской авиации Кыргызской Республики", где говорилось об образовании в составе Министерства транспорта и связи Кыргызской Республики Государственного предприятия ""Кыргызаэронавигация" "для контроля за использованием воздушного пространства и управления воздушным движением с имущественным комплексом, необходимым для осуществления возложенных на него функций, с приданием статуса юридического лица".

В соответствии с Уставом, утвержденного Приказом Министерства транспорта и коммуникаций Кыргызской Республики за № 84 от 9 марта 2004 г., ГП «Кыргызаэронавигация» входит в состав и структуру Министерства транспорта и коммуникаций Кыргызской Республики (МТК КР). Высшим органом управления Предприятия является Министерство транспорта и коммуникаций Кыргызской Республики.

Государственное предприятие «Кыргызаэронавигация» имеет филиалы:

• Бишкекский филиал, который расположен в аэропорту «Манас»;
• Ошский филиал, расположенный в аэропорту Ош.

У каждого из филиалов имеются производственные мощности, здания и оборудование, куда входят центры Управления Воздушным Движением (УВД) основных и приписных аэропортов.

ГП «Кыргызаэронавигация» является членом нескольких международных организаций, наиболее известными из которых являются:

• Межгосударственный координационный Совет «ЕВРАЗИЯ»
• Ассоциация по организации планирования воздушного движения и потоков МАС «Восток»
• Информационно-Координационный Совет по проблемам долгов в сфере аэронавигационного обслуживания ИКСАНО

ГП «Кыргызаэронавигация» сотрудничает с такими организациями гражданской авиации как ИКАО, МАК, ЕВРОКОНТРОЛЬ.

 Список стран, с которыми подписаны Межправительственные соглашения о воздушном сообщении:

1. Гонконг (КНР) – подписано в Гонконге 15 июля 1999 года.
2. Монголия – подписано в Бишкеке 4 декабря 1999 года.
3. Республика Беларусь – подписано в Минске 2 февраля 2000 года.
4. Республика Украина – подписано в Бишкеке 23 февраля 1993 года.
5. Исламская Республика Иран - подписано в Тегеране 22 июня 1993 года.
6. Индия - подписано в Бишкеке 8 сентября 1993 года.
7. Исламская Республика Пакистан - подписано в Бишкеке 14 октября 1993 года.
8. Республика Туркменистан - подписано в Ашгабате 24 декабря 1993 года.
9. Республика Казахстан - подписано в Алматы 18 февраля 1994 года.
10. Республика Турция - подписано в Анкаре 14 октября 1994 года.
11. Соединенное Королевство Великобритании и Северной Ирландии - подписано в Лондоне 8 декабря 1994 года.
12. Республика Индонезия - подписано в Джакарте 18 июля 1995 года.
13. Российская Федерация - подписано в Москве 28 марта 1996 года.
14. Китайская Народная Республика - подписано в Бишкеке 4 июля 1996 года.
15. Республика Узбекистан - подписано в Бишкеке 9 ноября 1994 года.
16. Грузия - подписано в Тбилиси 22 апреля 1997 года.
17. Федеративная Республика Германия - подписано в Бишкеке 13 мая 1997 года.
18. Австрия - подписано в Вене 17 марта 1998 года.
19. Королевство Таиланд – подписано в Бишкеке 2 июля 2001 года.
20. Малайзия – подписано в Куала-Лумпуре 17 ноября 2000 года.
21. Армения – подписано в Бишкеке 4 апреля 2002 года.
22. Швейцария – подписано в Бишкеке 25 октября 2002 года.
23. Чешская Республика – подписано в Праге 29 апреля 2004 года.
24. Таджикистан – подписано в Душанбе 26 мая 2004 года.
25. Греческая Республика – подписано в Афинах 1 ноября 2004 года.